MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011314	ATT	2	6	23340	23345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967969
502	NC_011314	TAA	2	6	23396	23401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967969
503	NC_011314	AAC	2	6	23403	23408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967969
504	NC_011314	TAT	2	6	23453	23458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967969
505	NC_011314	AAT	2	6	23463	23468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967969
506	NC_011314	GTG	2	6	23488	23493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967969
507	NC_011314	GTG	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967969
508	NC_011314	CAAT	2	8	23536	23543	50 %	25 %	0 %	25 %	209967969
509	NC_011314	AGC	2	6	23548	23553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967969
510	NC_011314	TA	3	6	23556	23561	50 %	50 %	0 %	0 %	209967969
511	NC_011314	GAT	2	6	23573	23578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967969
512	NC_011314	ATC	2	6	23580	23585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967969
513	NC_011314	AGC	2	6	23599	23604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967969
514	NC_011314	TTA	2	6	23634	23639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967969
515	NC_011314	TGCA	2	8	23647	23654	25 %	25 %	25 %	25 %	209967969
516	NC_011314	A	6	6	23657	23662	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
517	NC_011314	ATT	2	6	23684	23689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967969
518	NC_011314	AT	3	6	23743	23748	50 %	50 %	0 %	0 %	209967969
519	NC_011314	AACAA	2	10	23863	23872	80 %	0 %	0 %	20 %	209967969
520	NC_011314	A	6	6	23892	23897	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
521	NC_011314	AAT	2	6	23915	23920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967969
522	NC_011314	CTA	2	6	24087	24092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967970
523	NC_011314	TGT	2	6	24103	24108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967970
524	NC_011314	TTTA	2	8	24190	24197	25 %	75 %	0 %	0 %	209967970
525	NC_011314	GCC	2	6	24242	24247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209967970
526	NC_011314	TGG	2	6	24250	24255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967970
527	NC_011314	GCTA	2	8	24259	24266	25 %	25 %	25 %	25 %	209967970
528	NC_011314	TTG	2	6	24269	24274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967970
529	NC_011314	CT	3	6	24302	24307	0 %	50 %	0 %	50 %	209967970
530	NC_011314	TTA	2	6	24399	24404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967970
531	NC_011314	T	7	7	24412	24418	0 %	100 %	0 %	0 %	209967970
532	NC_011314	GCT	2	6	24422	24427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967970
533	NC_011314	CTG	2	6	24504	24509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967970
534	NC_011314	GTTA	2	8	24523	24530	25 %	50 %	25 %	0 %	209967970
535	NC_011314	TTG	2	6	24533	24538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967970
536	NC_011314	ATTT	2	8	24566	24573	25 %	75 %	0 %	0 %	209967970
537	NC_011314	GAA	2	6	24608	24613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967970
538	NC_011314	TAA	2	6	24640	24645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967970
539	NC_011314	TCA	2	6	24683	24688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967970
540	NC_011314	TTGG	2	8	24714	24721	0 %	50 %	50 %	0 %	209967970
541	NC_011314	T	6	6	24751	24756	0 %	100 %	0 %	0 %	209967970
542	NC_011314	TGG	2	6	24802	24807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967970
543	NC_011314	TGC	2	6	24832	24837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967970
544	NC_011314	TAT	2	6	24871	24876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967970
545	NC_011314	GTGG	2	8	24936	24943	0 %	25 %	75 %	0 %	209967970
546	NC_011314	TGG	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967971
547	NC_011314	TTA	2	6	25265	25270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967971
548	NC_011314	ATG	2	6	25278	25283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967971
549	NC_011314	AGCG	2	8	25299	25306	25 %	0 %	50 %	25 %	209967971
550	NC_011314	G	6	6	25326	25331	0 %	0 %	100 %	0 %	209967971
551	NC_011314	AAC	2	6	25336	25341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967971
552	NC_011314	ATGTG	2	10	25373	25382	20 %	40 %	40 %	0 %	209967971
553	NC_011314	TA	3	6	25483	25488	50 %	50 %	0 %	0 %	209967971
554	NC_011314	GCA	2	6	25502	25507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967971
555	NC_011314	ACT	2	6	25569	25574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967971
556	NC_011314	GAA	2	6	25693	25698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967971
557	NC_011314	CTTT	2	8	25736	25743	0 %	75 %	0 %	25 %	209967972
558	NC_011314	ATT	2	6	25749	25754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967972
559	NC_011314	GAT	2	6	25766	25771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967972
560	NC_011314	TGG	2	6	25897	25902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967972
561	NC_011314	TGT	2	6	25948	25953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967972
562	NC_011314	AGA	2	6	25981	25986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967972
563	NC_011314	TGG	2	6	25994	25999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967972
564	NC_011314	GA	3	6	26038	26043	50 %	0 %	50 %	0 %	209967972
565	NC_011314	TTGC	2	8	26103	26110	0 %	50 %	25 %	25 %	209967972
566	NC_011314	ACT	2	6	26128	26133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967972
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568	NC_011314	CA	3	6	26220	26225	50 %	0 %	0 %	50 %	209967972
569	NC_011314	GCA	2	6	26252	26257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967972
570	NC_011314	TTAC	2	8	26337	26344	25 %	50 %	0 %	25 %	209967972
571	NC_011314	GGC	2	6	26389	26394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967972
572	NC_011314	ATCT	2	8	26431	26438	25 %	50 %	0 %	25 %	209967972
573	NC_011314	AT	3	6	26454	26459	50 %	50 %	0 %	0 %	209967972
574	NC_011314	GAT	2	6	26834	26839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967972
575	NC_011314	GTG	2	6	26844	26849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967972
576	NC_011314	ATC	2	6	26880	26885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967972
577	NC_011314	ATT	2	6	26917	26922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967972
578	NC_011314	AT	3	6	26928	26933	50 %	50 %	0 %	0 %	209967972
579	NC_011314	ATTA	2	8	26941	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	209967972
580	NC_011314	CCT	2	6	27006	27011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_011314	TTAT	2	8	27160	27167	25 %	75 %	0 %	0 %	209967973
582	NC_011314	GATT	2	8	27195	27202	25 %	50 %	25 %	0 %	209967973
583	NC_011314	T	6	6	27213	27218	0 %	100 %	0 %	0 %	209967973
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585	NC_011314	CAA	2	6	27327	27332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967973
586	NC_011314	AAGGC	2	10	27375	27384	40 %	0 %	40 %	20 %	209967973
587	NC_011314	CG	3	6	27542	27547	0 %	0 %	50 %	50 %	209967973
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589	NC_011314	TTC	2	6	27562	27567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967973
590	NC_011314	ACGG	2	8	27582	27589	25 %	0 %	50 %	25 %	209967973
591	NC_011314	GCG	2	6	27609	27614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967973
592	NC_011314	TTTG	2	8	27730	27737	0 %	75 %	25 %	0 %	209967973
593	NC_011314	AT	3	6	27914	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	209967973
594	NC_011314	AATA	2	8	28000	28007	75 %	25 %	0 %	0 %	209967973
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597	NC_011314	ATC	2	6	28157	28162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967973
598	NC_011314	TGA	2	6	28180	28185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967973
599	NC_011314	TAAC	2	8	28365	28372	50 %	25 %	0 %	25 %	209967973
600	NC_011314	ACA	2	6	28491	28496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967973
601	NC_011314	AAT	2	6	28529	28534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011314	AAC	2	6	28594	28599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011314	TCA	2	6	28604	28609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011314	CT	3	6	28625	28630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_011314	C	7	7	28641	28647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_011314	CAT	2	6	28694	28699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011314	CTGGA	2	10	28760	28769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_011314	A	9	9	28865	28873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011314	CAGC	2	8	28880	28887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_011314	TTG	2	6	28978	28983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011314	ATT	2	6	29035	29040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011314	ATA	2	6	29073	29078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011314	TTG	2	6	29167	29172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011314	AT	3	6	29197	29202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011314	CAA	2	6	29273	29278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011314	TAAA	2	8	29364	29371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011314	TGC	2	6	29383	29388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011314	CTG	2	6	29396	29401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011314	TTG	2	6	29572	29577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011314	TTA	2	6	29611	29616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011314	GAA	2	6	29636	29641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011314	TAA	2	6	29656	29661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011314	TCG	2	6	29698	29703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011314	AAT	2	6	29732	29737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011314	CGA	2	6	29745	29750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011314	T	7	7	29837	29843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011314	AGA	2	6	29883	29888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011314	GAT	2	6	29889	29894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011314	TAG	2	6	29903	29908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011314	G	6	6	29908	29913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011314	TTC	2	6	29945	29950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011314	TTG	2	6	29971	29976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011314	GAA	2	6	30035	30040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011314	TAA	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011314	TCG	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011314	AAT	2	6	30131	30136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011314	CGA	2	6	30144	30149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_011314	ATT	2	6	30237	30242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011314	AAC	2	6	30259	30264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_011314	AGA	2	6	30286	30291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_011314	GAT	2	6	30292	30297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011314	TAG	2	6	30306	30311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_011314	GAT	2	6	30337	30342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_011314	TAC	2	6	30347	30352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_011314	T	6	6	30355	30360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_011314	CGT	3	9	30368	30376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_011314	GTC	2	6	30507	30512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_011314	TCAG	2	8	30574	30581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
649	NC_011314	GCA	2	6	30590	30595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_011314	TAA	2	6	30596	30601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_011314	A	7	7	30689	30695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_011314	T	6	6	30715	30720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_011314	CCTTA	2	10	30756	30765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

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